Svet guvernerjev je organ, ki vodi in usmerja delo Mednarodne agencije za atomsko energijo v času med dvema zasedanjema Generalne konference. Sestavljen je iz 35 guvernerjev, tj. predstavnikov držav članic Agencije.

Generalna konferenca vsako leto v skladu z dogovorom o regionalni zastopanosti zamenja del predstavnikov v Svetu. Mandat posamezne države članice Sveta traja dve leti. Od septembra 2005 do septembra 2007 je članica Sveta guvernerjev MAAE tudi Slovenija kot predstavnica vzhodnoevropske skupine držav. Slovenski guverner je Andrej Stritar, direktor URSJV.

Svet guvernerjev na leto redno zaseda povprečno šestkrat, in sicer v vlogi Sveta guvernerjev, kot Odbor za program in proračun in kot Odbor za pomoč in sodelovanje. Od  leta 2005 deluje tudi novonastali posvetovalni Odbor za varovanje jedrskega materiala in verifikacijo.